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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
26/04/2010 |
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Data da última atualização: |
24/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
SILVA, M. V. G. B.; VANRADEN, P. M.; VAN TASSEL, C. P.; SOSTENGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L. K.; KIM, E.; WIGGANS, G. R. |
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Afiliação: |
MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; PAUL M. VANRADEN, USDA; CURT P. VAN TASSEL, USDA; TAD S. SOSTENGARD, USDA; LAKSHMI K. MATUKUMALLI, GEORGE MASON UNIVERSITY; EUI-SOO KIM, USDA; GEORGE R. WIGGANS, USDA. |
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Título: |
Análise de associação por todo o genoma para identificar locos relacionados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas na raça Jersey. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais... Maringá: SBZ, 2009. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Foi realizada uma varredura por todo o genoma de animais da raça Jersey, nos EUA, utilizando marcadores do tipo SNP, visando identificar QTL associados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas. Os dados usados neste estudo foram provenientes do Animal Improvement Programs Laboratory, USDA/EUA. Amostras de DNA coletadas de 2.380 animais da raça Jersey e as habilidades preditas de transmissão de 2.081 animais, publicadas em fevereiro/2009 (http://greenbook.usjersey.com/), foram utilizadas nas análises. Para a genotipagem dos SNPs foi usado o BovineSNP50 BeadChip da Illumina, com aproximadamente 54.000 SNPs. Todo SNP com call rate (<99%), em desequilíbrio de Hardy-Weinberg (teste exato p<0,01) e com frequência de um dos alelos menor do que 5% foram excluídos das análises finais (30.342 SNP usados). P-values corrigidos pelo teste de Bonferroni iguais a 0,01 foram usados. Para todas as características, SNP significativos foram encontrados em vários cromossomos, especialmente nos BTAs 3, 4, 5, 6, 10, 12, 23 e 25. Os resultados sugerem que as soluções para os efeitos dos marcadores nas avaliações genômicas podem identificar regiões cromossômicas que necessitem ser melhor estudadas. |
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Palavras-Chave: |
Associação por todo genoma. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/711787/1/Analise-de-associacao-por-todo-o-genoma.pdf
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Marc: |
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520 $aFoi realizada uma varredura por todo o genoma de animais da raça Jersey, nos EUA, utilizando marcadores do tipo SNP, visando identificar QTL associados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas. Os dados usados neste estudo foram provenientes do Animal Improvement Programs Laboratory, USDA/EUA. Amostras de DNA coletadas de 2.380 animais da raça Jersey e as habilidades preditas de transmissão de 2.081 animais, publicadas em fevereiro/2009 (http://greenbook.usjersey.com/), foram utilizadas nas análises. Para a genotipagem dos SNPs foi usado o BovineSNP50 BeadChip da Illumina, com aproximadamente 54.000 SNPs. Todo SNP com call rate (<99%), em desequilíbrio de Hardy-Weinberg (teste exato p<0,01) e com frequência de um dos alelos menor do que 5% foram excluídos das análises finais (30.342 SNP usados). P-values corrigidos pelo teste de Bonferroni iguais a 0,01 foram usados. Para todas as características, SNP significativos foram encontrados em vários cromossomos, especialmente nos BTAs 3, 4, 5, 6, 10, 12, 23 e 25. Os resultados sugerem que as soluções para os efeitos dos marcadores nas avaliações genômicas podem identificar regiões cromossômicas que necessitem ser melhor estudadas.
653 $aAssociação por todo genoma
700 1 $aVANRADEN, P. M.
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700 1 $aSOSTENGARD, T. S.
700 1 $aMATUKUMALLI, L. K.
700 1 $aKIM, E.
700 1 $aWIGGANS, G. R.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| 5. |  | MELO, I. da C.; RAMOS, G. Q.; AMARAL, A. C. F.; TADEI, W. P.; CHAVES, F. C. M.; SANCHES, E. A.; FONSECA FILHO, H. D. da. Chemical composition, cytotoxicity, larvicidal, antimicrobial, adulticidal activities against Aedes aegypti of essential oils from leaves of Piper cytorphodon and Piper krukoffii Yunck. European Academic Research, v. 8, n. 11, p. 7032-7046, Febr. 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 6. | | MORAES, W. A.; REIS, R. P.; FONSECA FILHO, H.; TALITANE, I. C.; NORONHA, J. F. de; NEVES, E. M.; FERREIRA NETO, J.; FARIA, J. M. R. Custo de implantacao de seringal cultivado nos estados de Minas Gerais, Espirito Santo e Rio de Janeiro. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE ECONOMIA FLORESTAL, 1., 1988, Curitiba. Anais. Curitiba: EMBRAPA-CNPF, 1988. v. 2, p. 335-368.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 7. | | ROCHA, A. L. F.; NUNES, R. Z. de A.; MATOS, R. S.; FONSECA FILHO, H. D. da; BEZERRA, J. de A.; LIMA, A. R.; GUIMARÃES, F. E. G.; PAMPLONA, A. M. S. R.; MAJOLO, C.; SOUZA, M. G. de; CAMPELO, P. H.; TÃLU, s.; BAGNATO, V. S.; INADA, N. M.; SANCHES, E. A. Alternative controlling agent of Theobroma grandiflorum pests: nanoscale surface and fractal analysis of gelatin/PCL loaded particles containing Lippia origanoides essential oil. Nanomaterials, v. 12, n. 15, art. 2712, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 8. | | SILVA, J. M. S. da; RABELO, M. da S.; LIMA, S. X.; ROCHA, A. L. F.; FONSECA FILHO, H. D. da; OLIVEIRA, A. C. de; TADEI, W. P.; CHAVES, F. C. M.; BEZERRA, J. de A.; BIONDO, M. M.; CAMPELO, P. H.; SANCHES, E. A. Biodegradable nanoparticles loaded with Lippia alba essential oil: a sustainable alternative for Aedes aegypti larvae control. European Academic Research, v. 7, n. 12, p. 6237-6258, Mar. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 9. | | OLIVEIRA, L. R. de; GONÇALVES, D. S.; CAROLINO, A. S.; FACCINATTO, W. M.; MENEZES. D. C.; DIAS, C. O.; COLNAGO, L. A.; RUIZ, Y. L.; IU, S. T.; FONSECA FILHO, H. D.; CHAUDHURI, P.; CAMPELO, P. H.; MASCARENHAS, I. P.; SANCHES, E. A. Head-to-tail and head-to-head molecular chains of poly(p-anisidine): Combined experimental and theoretical evaluation. Molecules, v. 27, a6326, 2022. 28 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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